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12月1日-2日,由浙江大學(xué)農生環(huán)測試中心主辦,杭州寶誠生物技術(shù)有限公司與Oxford NanoporeTechnologies聯(lián)合承辦的“單細胞納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)研討會(huì )” 圓滿(mǎn)落幕。
本次研討會(huì )上,來(lái)自單細胞不同研究領(lǐng)域的科學(xué)家們進(jìn)行了專(zhuān)題報告,分享了他們利用納米孔測序進(jìn)行單細胞相關(guān)研究的成果,內容涵蓋了空間組學(xué)、癌癥研究、微生物、人類(lèi)基因組、創(chuàng )新方法學(xué)研究等多個(gè)應用領(lǐng)域,本次會(huì )議共吸引了一百五十余位專(zhuān)家,共同探討學(xué)習單細胞納米孔測序技術(shù)應用的現狀與未來(lái)。
精彩回顧
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鄭紹建教授致辭
浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院學(xué)部副部長(cháng)
浙江省植物生理與植物分子生物學(xué)學(xué)會(huì )理事長(cháng)
鄭紹建教授為大會(huì )做開(kāi)幕致辭。鄭紹建教授對杭州寶誠生物技術(shù)有限公司在生命科學(xué)領(lǐng)域新技術(shù)的引進(jìn)與推廣方面做出的貢獻給予了高度的評價(jià),希望通過(guò)本次研討會(huì ),推進(jìn)單細胞測序技術(shù)發(fā)展,促進(jìn)納米孔測序技術(shù)實(shí)際應用,提升學(xué)術(shù)及數據分析水平。
浙江大學(xué)農生環(huán)測試中心副主任王華教授
寶誠生物董事長(cháng)施覺(jué)亮先生
一起聽(tīng)取大會(huì )報告
從單細胞到空間單細胞全長(cháng)轉錄組測序
在癌癥耐藥研究中的應用
田魯亦研究員
廣州國家實(shí)驗室
田魯亦研究員系統性地介紹了從單細胞到空間單細胞領(lǐng)域的基礎技術(shù)路線(xiàn),分享了其團隊基于單細胞納米孔測序技術(shù)開(kāi)發(fā)的分析工具Flames以及通過(guò)納米孔全長(cháng)轉錄組測序技術(shù)發(fā)現癌癥耐藥相關(guān)突變以及機制研究,同時(shí)分享了空間轉錄組測序的相關(guān)案例。
納米孔與單細胞結合帶來(lái)的機會(huì )與挑戰
陳磊研究員
上海交通大學(xué)醫學(xué)附屬仁濟醫院
陳磊研究員詳細介紹了與傳統測序技術(shù)相比較,納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)為單細胞測序帶來(lái)了新的可能。報告指出,納米孔測序技術(shù)結合單細胞能夠鑒定更多的轉錄物/轉錄物異構體,更精細的聚類(lèi),更準確的區分轉錄物和假基因等。
基于Oxford Nanopore平臺的單細胞全長(cháng)轉錄組測序
嚴舒琪女士
牛津納米孔技術(shù)應用專(zhuān)家
嚴舒琪女士首先介紹了納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)在單細胞以及空間組學(xué)研究領(lǐng)域可以揭示在常規短讀長(cháng)測序技術(shù)中丟失的新維度信息,包含全長(cháng)轉錄本結構、可變剪切、融合基因等,同時(shí)嚴舒琪女士系統性回顧了納米孔測序在單細胞領(lǐng)域以及空間組學(xué)的應用研究,介紹了單細胞平臺加納米孔測序平臺加分析的整體解決方案。
單細胞全長(cháng)轉錄組解析腫瘤細胞異質(zhì)性
龔亮研究員
浙江大學(xué)良渚實(shí)驗室
龔亮研究員的報告詳細介紹了前沿的納米孔測序技術(shù)結合單細胞測序,相對二代短讀長(cháng)測序技術(shù)可以更好地對腫瘤細胞異質(zhì)性進(jìn)行解析,尤其通過(guò)全長(cháng)RNA測序可以提供更高分辨率的細胞亞群鑒定,可以更好地鑒定新基因或者新轉錄本。
高通量測序技術(shù)的應用和挑戰
毛偉華教授
浙江大學(xué)農生環(huán)測試中心
毛偉華教授系統性介紹了測序技術(shù)的發(fā)展歷程以及浙大農生環(huán)分析測試中心的測序平臺,其中重點(diǎn)介紹了納米孔測序技術(shù)超長(cháng)讀長(cháng)、直接測序、實(shí)時(shí)測序等技術(shù)優(yōu)勢,以及利用浙大農生環(huán)測序中心納米孔測序平臺幫助浙大師生合作完成的科研成果,包括在微生物基因組測序和植物全長(cháng)CircRNA測序等領(lǐng)域的應用案例。
MobiNova?跨平臺、多物種單細胞多組學(xué)解決方案
王夢(mèng)心女士
墨卓生物高級產(chǎn)品經(jīng)理
王夢(mèng)心女士介紹到,墨卓MobiNova?-100單細胞測序建庫系統,基于分子標簽(barcode)的單細胞識別,利用獨家專(zhuān)利的標簽和油包水技術(shù),可對多種樣本自動(dòng)完成單細胞分離、細胞裂解、核酸捕獲,是高質(zhì)量、端到端的高通量單細胞測序建庫系統。
數據實(shí)操
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納米孔測序以其“超長(cháng)讀長(cháng)、直接DNA/RNA測序、實(shí)時(shí)測序、操作簡(jiǎn)單”等優(yōu)勢受到科研與臨床等各研究領(lǐng)域專(zhuān)家的高度關(guān)注。但是數據分析一直是很多科學(xué)家較為關(guān)心的話(huà)題,本屆單細胞研討會(huì )特別聯(lián)合及智(蘇州)醫學(xué)技術(shù)有限公司的專(zhuān)業(yè)生信團隊,開(kāi)展單細胞納米孔測序數據分析實(shí)操培訓班,帶領(lǐng)大家完成了二代單細胞與三代全長(cháng)轉錄本合并分析,此次培訓班包含擬時(shí)序、組間差異、富集分析、轉錄本關(guān)聯(lián)膜蛋白、分泌蛋白、轉錄因子等一系列分析,同時(shí)并就單細胞全長(cháng)轉錄本數據特點(diǎn)及分析難點(diǎn)進(jìn)行了全面透徹的解析。
單細胞全長(cháng)轉錄測序分析技術(shù)測評
陳磊研究員
上海交通大學(xué)醫學(xué)附屬仁濟醫院
單細胞全長(cháng)測序:cDNA水平的單細胞遺傳變異研究
程小濤總經(jīng)理
及智(蘇州)醫學(xué)技術(shù)有限公司
基于單細胞全長(cháng)轉錄組的抗體、核酸藥物研發(fā)策略
梁輝常務(wù)副所長(cháng)
蘇州思萃免疫技術(shù)研究所
生信培訓現場(chǎng)學(xué)員照片
至此,本次研討會(huì )順利結束,希望通過(guò)本次研討會(huì ),為大家帶來(lái)最熱門(mén)、最前沿的單細胞研究,推進(jìn)納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序在單細胞領(lǐng)域的應用,期待未來(lái)與各位專(zhuān)家學(xué)者更多的交流與合作。
合影留念
寶誠生物集團創(chuàng )立于1997年7月,在生命科學(xué)和大健康領(lǐng)域中致力于引進(jìn)、推廣國內外先進(jìn)技術(shù)與產(chǎn)品,是一家集技術(shù)開(kāi)發(fā)與推廣、產(chǎn)品銷(xiāo)售、售后服務(wù)等為一體的綜合發(fā)展的高科技公司,與全球最前沿的著(zhù)名企業(yè)如Bio-Rad、Danaher集團、LONZA、Waters、Nanopore、Abcam、Nanolive、3D Histech、杭州柏熠等建立了良好的合作關(guān)系??偛吭O立于浙江杭州,在江蘇、安徽、江西、福建、湖北等地設立了分公司或辦事處。
公司努力追蹤生命科學(xué)領(lǐng)域的最新技術(shù)和發(fā)展,長(cháng)期舉辦各種技術(shù)培訓和講座,將全球先進(jìn)的技術(shù)和產(chǎn)品推薦給國內用戶(hù),使國外最新的研發(fā)技術(shù)能盡快地服務(wù)于廣大科研人員。自成立以來(lái),一直遵循“誠實(shí)、誠懇、誠信”的價(jià)值觀(guān)和為客戶(hù)提供最先進(jìn)的研究工具和整體解決方案的使命,憑借自身先進(jìn)的經(jīng)營(yíng)理念、雄厚的綜合實(shí)力、卓越的人才隊伍、優(yōu)秀的團隊管理等方面的優(yōu)勢,與各大高校、科研院所、醫院、政府實(shí)驗室、生物制藥等生命科學(xué)和化工領(lǐng)域的用戶(hù)建立了良好的合作關(guān)系,也得到了廣大用戶(hù)的認可和支持,在同行及用戶(hù)中樹(shù)立了良好的信譽(yù)和口碑。
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