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新聞資訊

在生命科學(xué)領(lǐng)域中致力于引進(jìn)、推廣國內外先進(jìn)技術(shù)與產(chǎn)品

首頁(yè) / 服務(wù)支持

【邀請函】單細胞納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)研討會(huì )

2023-11-10

會(huì )議簡(jiǎn)介:

——

單細胞多組學(xué)測序技術(shù)是指對一個(gè)單細胞同時(shí)檢測多個(gè)組學(xué)層面 (例如基因組、表觀(guān)基因組和轉錄組) 的測序技術(shù)。這類(lèi)技術(shù)對單個(gè)細胞進(jìn)行基因組和轉錄組異質(zhì)性分析為許多研究領(lǐng)域提供了新見(jiàn)解。利用傳統的短讀長(cháng)測序技術(shù)進(jìn)行單細胞測定存在局限性:例如,在轉錄組研究中無(wú)法在異構體方面確定轉錄本豐度。納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序能夠解決這些挑戰,可以在單條讀長(cháng)中對全長(cháng)轉錄本和大基因組區域進(jìn)行端到端的測序,并覆蓋重復區域和結構變異。2019年,Nature Methods雜志將單細胞多組學(xué)技術(shù)評為年度技術(shù)。2022年,Nature Methods雜志將長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)評為年度技術(shù)。納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)和單細胞技術(shù)的結合將為科學(xué)家研究解析單個(gè)細胞的行為、機制與機體的關(guān)系等提供了新方向。


12月1日-12月2日,我們將在浙江大學(xué)圓正·啟真酒店舉辦單細胞納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序技術(shù)研討會(huì )?,F場(chǎng),我們將為大家帶來(lái)最熱門(mén)、最前沿的研究,除此之外,我們還邀請多位演講嘉賓,與大家分享納米孔長(cháng)讀長(cháng)測序在單細胞領(lǐng)域的應用與展望,參會(huì )者將有機會(huì )與所有的演講者們進(jìn)行面對面交流,也可以近距離體驗Oxford Nanopore測序技術(shù)。歡迎大家報名參加!


主辦方

浙江大學(xué)農生環(huán)測試中心

承辦方

杭州寶誠生物技術(shù)有限公司

Oxford  Nanopore Technologies plc



會(huì )議日程:

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時(shí)間

內容

12月01日

09:00-09:30

會(huì )議簽到

09:30-09:40

歡迎致辭

09:40-10:10

主題:從單細胞到空間單細胞全長(cháng)轉錄組測序在癌癥研究中的應用以及未來(lái)展望     

嘉賓田魯亦 研究員 廣州國家實(shí)驗室

10:10- 10:40

主題:納米孔與單細胞結合帶來(lái)的機會(huì )與挑戰     

嘉賓陳磊 研究員 上海交通大學(xué)醫學(xué)院附屬仁濟醫院

10:40-11:00

主題:基于Oxford Nanopore平臺的單細胞全長(cháng)轉錄組測序     

嘉賓嚴舒琪 領(lǐng)域應用技術(shù)專(zhuān)家 Oxford  Nanopore Technologies

11:00-11:20

茶歇

11:20-11:50

標題:?jiǎn)渭毎L(cháng)轉錄組解析腫瘤細胞異質(zhì)性      

嘉賓龔亮 研究員 浙江大學(xué)醫學(xué)中心

11:50-12:10

標題:高通量測序技術(shù)的應用和挑戰     

嘉賓毛偉華 正高級實(shí)驗師 浙江大學(xué)分析測試中心

12:10-12:30

標題:MobiNova一站式、多組學(xué)、跨平臺單細胞解決方案      

嘉賓王夢(mèng)心 高級產(chǎn)品經(jīng)理 墨卓生物

12:30-13:30

午餐

13:30-14:15

標題單細胞全長(cháng)轉錄組技術(shù)測評      

嘉賓陳磊 研究員 上海交通大學(xué)醫學(xué)院附屬仁濟醫院

14:15-15:00

標題單細胞全長(cháng)測序:cDNA水平的單細胞遺傳變異研究     

嘉賓程小濤 總經(jīng)理 及智醫學(xué) 

15:00-15:45

標題:基于單細胞全長(cháng)轉錄本的抗體、核酸藥物研發(fā)策略       

嘉賓:梁輝 常務(wù)副所長(cháng) 蘇州思萃免疫技術(shù)研究所 

15:45-16:45

數據實(shí)操R語(yǔ)言相關(guān)軟件包的安裝與調試(Seurat、GSVA、Monocle、Shinny、SingleR等幾十種),Seurat分析流程介紹,以及cell ranger解讀。

16:45-17:45

數據實(shí)操:單細胞全長(cháng)轉錄本數據特點(diǎn)介紹及分析難點(diǎn)解析

12月02日

09:00-16:30

數據實(shí)操:?jiǎn)渭毎L(cháng)轉錄組原始數據特征(IGV演示

數據實(shí)操二代單細胞與三代全長(cháng)轉錄本合并分析細節(擬時(shí)序組間差異、富集分析、轉錄本關(guān)聯(lián)膜蛋白、分泌蛋白、轉錄因子等)

頒發(fā)結業(yè)證書(shū)




嘉賓介紹:

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田魯亦


廣州國家實(shí)驗室研究員,國家重大人才項目入選者(青年),本科和博士分別畢業(yè)于浙江大學(xué)和墨爾本大學(xué)的WEHI,之后在美國B(niǎo)road Institute從事研究工作,2022年11月加入廣州國家實(shí)驗室。課題組研究聚焦單細胞組學(xué),空間組學(xué)以及納米孔測序的新技術(shù)開(kāi)發(fā)和相關(guān)算法研發(fā),并使用這些新技術(shù)和新算法研究免疫學(xué)和呼吸疾病中的重要生物學(xué)問(wèn)題。以第一或通訊作者在Nature Methods,Nature Immunology,Immunity(封面文章),Nature Genetics,Nature Biotechnology,Blood等在內的專(zhuān)業(yè)雜志發(fā)表高水平論文,他引超過(guò)1800次、H-index為17。


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陳磊


上海交通大學(xué)醫學(xué)附屬仁濟醫院,課題組長(cháng),博導。于美國B(niǎo)aylor College of Medicine獲計算生物學(xué)博士學(xué)位。2017年獲中組部“青年千人”計劃支持并回國建立獨立實(shí)驗室。長(cháng)期從事測序數據的分析挖掘及相關(guān)工具開(kāi)發(fā)。目前課題組聚焦于腸道腫瘤免疫微環(huán)境,通過(guò)多組學(xué)數據挖掘,包括單細胞測序,空間轉錄組測序等,解析腸道免疫微生態(tài)中宿主免疫細胞及腸道菌群的互作。相關(guān)成果發(fā)表在Genome Research、Briefings in Bioinformatics等雜志上。


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嚴舒琪


本科畢業(yè)于武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,研究生畢業(yè)于美國紐約州立大學(xué)石溪分校。她在基因組學(xué)領(lǐng)域有超過(guò)15年的工作經(jīng)驗,曾在中美多家國際知名企業(yè)擔任研發(fā)科學(xué)家和產(chǎn)品經(jīng)理?,F在是Oxford Nanopore Technologies的現場(chǎng)應用專(zhuān)家。


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龔亮


浙江大學(xué)良渚實(shí)驗室“百人計劃”研究員,浙江大學(xué)醫學(xué)院附屬第一醫院雙聘研究員,博士生導師。主要聚焦第三代納米孔測序,結合表觀(guān)遺傳學(xué)、三維基因組學(xué)等前沿基因組技術(shù)和生物信息學(xué)分析工具,研究癌癥和遺傳疾病的基因組變異、轉錄調控及基因功能。在Nature Methods、Nature Genetics、PNAS、Trends in Cancer等國際著(zhù)名期刊上發(fā)表多篇論文,Google Scholar引用2900余次,主持國家自然科學(xué)基金面上項目,國家自然科學(xué)基金外國資深學(xué)者研究基金項目子課題負責人。擔任Genome Research、Nucleic Acids Research、G3、STAR Protocols、iMeta等學(xué)術(shù)期刊專(zhuān)業(yè)評審。


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毛偉華


正高級實(shí)驗師,主持并完成國家自然科學(xué)基金三項、省自然科學(xué)基金一項、省分析測試基金三項;獲得浙江省科學(xué)技術(shù)獎三等獎一項。擅長(cháng)多組學(xué)測序研究,目前致力于測序相關(guān)試劑盒的研發(fā),獲得2023 年省制造業(yè)高質(zhì)量發(fā)展產(chǎn)業(yè)鏈協(xié)同創(chuàng )新項目及2023年度第一批 “領(lǐng)雁”研發(fā)攻關(guān)計劃。



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王夢(mèng)心


墨卓生物高級產(chǎn)品經(jīng)理,2年病毒課題研究經(jīng)驗,參與2項國家自然基金項目與專(zhuān)利申請。4年分子生物學(xué)背景,熟練掌握NGS全流程實(shí)驗操作,在IVD領(lǐng)域具有三年以上的推廣經(jīng)驗,目前負責墨卓生物產(chǎn)品營(yíng)銷(xiāo)及學(xué)術(shù)推廣工作。


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程小濤


參與多項國家“863”項目和國家自然基金項目,高通量行業(yè)12年工作經(jīng)驗,精通多種高通量組學(xué)技術(shù)與單細胞數據分析技巧,參與了近百個(gè)課題組的單細胞數據分析工作,協(xié)助發(fā)表單細胞相關(guān)文章數十篇,一直專(zhuān)注臨床轉化方向,帶領(lǐng)團隊開(kāi)發(fā)出了國內首個(gè)基于10X、墨卓平臺的單細胞二代+三代測序全長(cháng)轉錄本靶點(diǎn)發(fā)現技術(shù),將單細胞靶點(diǎn)發(fā)現從基因水平深入到了轉錄本水平,為單細胞產(chǎn)業(yè)發(fā)展拓展出了新的臨床轉化思路。


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梁輝

現任蘇州思萃免疫技術(shù)研究所有限公司常務(wù)副所長(cháng)。博士畢業(yè)于中國科學(xué)院蘇州納米技術(shù)與納米仿生研究所,主要擅長(cháng)抗體藥物和細胞治療方面的項目研發(fā),具有近10年的學(xué)術(shù)經(jīng)歷和生物藥物研發(fā)經(jīng)驗,曾在國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表多篇相關(guān)高水平研究論文,已申請發(fā)明專(zhuān)利60多項。



報名須知:

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會(huì )議地點(diǎn):圓正.啟真酒店,杭州市西湖區余杭塘路866號(浙江大學(xué)紫金港校區內)。

報名方式:12月1日上午的報告免費報名參與,12月1日下午與12月2日全天的培訓每人收費1299元,兩人以上同行,每人999元。費用包含12月1日午餐晚餐茶歇和12月2日午餐茶歇。


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掃碼報名


付款方式:(付款請備注姓名、聯(lián)系方式、單位)

單位名稱(chēng):杭州寶誠生物技術(shù)有限公司

開(kāi)戶(hù)行及賬號:交通銀行杭州和平支行  331065910018010045452




寶誠生物集團創(chuàng )立于1997年7月,在生命科學(xué)和大健康領(lǐng)域中致力于引進(jìn)、推廣國內外先進(jìn)技術(shù)與產(chǎn)品,是一家集技術(shù)開(kāi)發(fā)與推廣、產(chǎn)品銷(xiāo)售、售后服務(wù)等為一體的綜合發(fā)展的高科技公司,與全球最前沿的著(zhù)名企業(yè)如Bio-Rad、Danaher集團、LONZA、Waters、Nanopore、Abcam、Nanolive、3D Histech、杭州柏熠等建立了良好的合作關(guān)系??偛吭O立于浙江杭州,在江蘇、安徽、江西、福建、湖北等地設立了分公司或辦事處。

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